عدم اصلاح نظام جامع کارمزد منجر به بروز مشکل در مدل کسب و کار صنعت پرداخت الکترونیکی شده تا جایی که ذینفعان این خدمت به پرداخت هزینه های آن عادت نکرده و بانک ها در حال حاضر جور این هزینه را می کشند.